运行状态
STR位点信息
格式: chr\tstart\tend\tstr_name，每行一个位点，网页版只支持chr6
运行日志 

                

                

                  
                   运行进度
                

                

                  
0%

                

              

            

            

              引物对结果
              

                

                  
                   设计的引物对
                

                

                

                  

                

              

              

                

                  
                   统计摘要
                

                

              

            

            

              CE报告
              

                

                  
                   CE模式引物报告
                

                

                

                  

                    

                  

                

                

                  

                    
                     CE报告仅在CE模式运行完成后生成，请先选择CE模式并运行引物设计。
                  

                

              

            

            

              帮助
              

                

                  
                   STRprimer使用说明
                

                

                

                  
                   输入格式
                

                
每行一个STR位点，使用TAB分隔，包含以下4列：

                
    
                  
  1. 
                    chr
                     - 染色体名称
                  
    2. 
                  
  2. 
                    start
                     - 起始位置
                  
    3. 
                  
  3. 
                    end
                     - 结束位置
                  
    4. 
                  
  4. 
                    str_name
                     - STR位点名称
                  
    5. 
                

                

                

                  
                   示例输入
                

                
chr6	32517609	32522465	DRB51
chr6	32587495	32590129	DRB12

                

                

                  
                   引物排除面板说明
                

                

                  排除与已有引物不兼容的位点
                  ：排除与这些引物不兼容的引物
                

                

                  直接移除
                  ：输入的引物序列会从候选引物中直接移除
                

                

                

                  
                   运行流程
                

                
    
                  
  1. 解析STR位点信息
    2. 
                  
  2. 为每个位点生成候选引物
    3. 
                  
  3. 引物质量过滤
    4. 
                  
  4. 排除与旧引物不兼容的候选引物
    5. 
                  
  5. 移除指定引物
    6. 
                  
  6. 跨位点特异性检查
    7. 
                  
  7. 引物选择优化
    8. 
                

                

                

                  
                   输出列说明
                

                
    
                  
  • 
                    primer_5 / primer_3
                     - 正向/反向引物序列
                  
    • 
                  
  • 
                    temp_5 / temp_3
                     - 正向/反向引物Tm值
                  
    • 
                  
  • 
                    amplicon_size
                     - 扩增子大小
                  
    • 
                  
  • 
                    dis_5 / dis_3
                     - 引物到STR区域的距离
                  
    • 
                  
  • 
                    flank_5 / flank_3
                     - 侧翼序列长度
                  
    • 
                  
  • 所有的引物都兼容
    • 
                  
  • 这里的兼容性考量包括温度、二聚体、长度等
    • 
                

                

                

                  
                   CE模式参数说明
                

                
    
                  
  • 
                    荧光颜色数量 (f_color_n)
                     - CE模式使用的荧光染料种类数，最多3种，默认2种
                  
    • 
                  
  • CE模式下会生成PDF格式的引物报告 (primer_pair_report_amplicon_sizes.pdf)
    • 
                

                

                

                  
                   注意事项
                

                
    
                  
  • 建议使用TAB作为分隔符
    • 
                  
  • 只选取引物周围0-1000区域设计引物，如果设计失败，请查看扩增子大小是否合适
    • 
                  
  • 3个位点以上的引物设计的费用或者CE平台多重多通道引物设计，请联系limeng49631@aliyun.com或者加V+ tangyuan357111317
    • 
                

              

            

            

              引物分析
              

                

                  
                   引物特异性和二聚体分析
                

                

                  
                  
                

                

                  
                   每行一条引物序列，自动命名为primer1, primer2...
                

                
                

                  

                    

                      

                        
                        

                          
                        

                      

                    

                  

                  

                    

                      

                        
                        

                          
                        

                      

                    

                  

                

                
                

                

                

                  
二聚体结果

                  

                  
                  

                  

                  
非特异性结果